This panel contains genes that cause conditions with stroke or stroke-like episodes. It was developed and is maintained by RMH and is a consensus panel used by VCGS. Consider applying the Bleeding and Platelet disorders, Aortopathy_Connective Tissue Disorders and Cerebral Vascular Malformations panels based on the clinical features.
Kristin Rigbye (Victorian Clinical Genetics Services)
Natasha Brown (Victorian Clinical Genetics Services)
Natalie Tan (Victorian Clinical Genetics Services)
Chris Richmond (Genetic Health Queensland)
Eleanor Williams (Genomics England)
Arina Puzriakova (Genomics England)
Samantha Ayres (Victorian Clinical Genetics Services)
Danielle Ariti (University of Melbourne)
Manny Jacobs (Victorian Clinical Genetics Services)
Teresa Zhao (Victorian Clinical Genetics Services)
Ain Roesley (Victorian Clinical Genetics Services)
Achchuthan Shanmugasundram (Genomics England)
Suliman Khan (Victorian Clinical Genetics Services)
Elena Savva (Victorian Clinical Genetics Services)
Ee Ming Wong (Victorian Clinical Genetics Services)
Bryony Thompson (Royal Melbourne Hospital)
Paul De Fazio (Victorian Clinical Genetics Services)
Seb Lunke (Victorian Clinical Genetics Services)
Katrina Bell (Murdoch Children's Research Institute)
Krithika Murali (Victorian Clinical Genetics Services)
Zornitza Stark (Victorian Clinical Genetics Services)
| List | Entity | Reviews | Mode of inheritance | Details | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Green List (high evidence) | ABCA1 | 3 reviews3 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ABCC6 | 3 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ACAD9 | 1 review1 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ACTA2 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ACVRL1 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ADA2 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ADAMTS13 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | APP | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ARHGEF15 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ASS1 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | CBS | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | CCM2 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | CD59 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | COL3A1 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | COL4A1 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | COL4A2 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | COLGALT1 | 1 review1 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | CTSA | 3 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | ENG | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | FOXC1 | 3 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | GLA | 1 review1 green | X-LINKED: hemizygous mutation in males, biallelic mutations in females | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | GUCY1A3 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | HBB | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | HTRA1 | 2 reviews2 green | BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | JAG1 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | JAM3 | 1 review1 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | KRIT1 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | MMACHC | 1 review1 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | MUT | 1 review1 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | NF1 | 3 reviews3 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | NIT1 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | NOTCH2 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | NOTCH3 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | OTC | 2 reviews2 green | X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PCCA | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PCCB | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PDCD10 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PDE3A | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PDGFRB | 4 reviews3 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | POLG | 2 reviews2 green | BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PROC | 2 reviews2 green | BOTH monoallelic and biallelic (but BIALLELIC mutations cause a more SEVERE disease form), autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | PROS1 | 2 reviews2 green | BOTH monoallelic and biallelic (but BIALLELIC mutations cause a more SEVERE disease form), autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | RNF213 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | SAMHD1 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | SCN5A | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | SERPINC1 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | SLC2A10 | 1 review1 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | SMAD4 | 1 review1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | SMARCAL1 | 2 reviews2 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | STIM1 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | TREX1 | 2 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | TTR | 3 reviews2 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Green List (high evidence) | YY1AP1 | 3 reviews3 green | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Amber List (moderate evidence) | ANO1 | 4 reviews | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Amber List (moderate evidence) | CST3 | 2 reviews1 green | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Amber List (moderate evidence) | FLNA | 2 reviews1 green | Other | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Amber List (moderate evidence) | FOXM1 | 1 review | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Red List (low evidence) | MAP3K6 | 1 review1 red | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Red List (low evidence) | MYH11 | 1 review1 red | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Red List (low evidence) | NOS3 | 4 reviews3 red | Unknown | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Red List (low evidence) | TRIM47 | 1 review1 red | MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Red List (low evidence) | WFS1 | 3 reviews2 green 1 red | BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | Sources
 Phenotypes
 Tags | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2021-05-21 08:16 Zornitza Stark (Victorian Clinical Genetics Services; Australian Genomics) promoted panel to 1.0
Fully reviewed and promoted to V1.